1．轉染試劑
不同細胞培養基轉染效率通常不同，但細胞系的選擇通常是根據實驗的需要，因此在轉染實驗前應根據實驗要求和細胞特性選擇適合的轉染試劑。每種轉染試劑都會提供一些已經成功轉染的細胞株列表和文獻，通過這些資料可選擇實驗設計的轉染試劑。當然，的是、低毒、方便、廉價的轉染試劑。
2．細胞狀態
一般低的細胞代數（<50）能確保基因型不變。轉染的細胞是經過幾次傳代后達到指數生長期的細胞，細胞生長旺盛，zui容易轉染。細胞培養基在實驗室中保存數月和數年后會經歷突變，總染色體重組或基因調控變化等而演化。這會導致和轉染相關的細胞行為的變化。也就是說同一種系的細胞株，在各實驗室不同培養條件下，其生物學性狀發生不同程度的改變，導致其轉染特性也發生變化。因此，如果發現轉染效率降低，可以試著轉染新鮮培養的細胞以恢復*結果。
3．轉染方法
不同轉染試劑有不同的轉染方法，但大多大同小異。轉染時應跟據具體轉染試劑推薦的方法，但也要注意，因不同實驗室培養基的細胞性質不同，質粒定量差異，操作手法上的差異等，其轉染效果可能不同，應根據實驗室的具體條件來確定*轉染條件。
（1）細胞培養物
健康的細胞培養物是成功轉染的基礎。不同細胞有不同的培養基，血清和添加物。高的轉染效率需要一定的細胞密度，一般的轉染試劑都會有專門的說明。推薦在轉染前24 小時分細胞，這將提供正常細胞代謝，增加對外源DNA 攝入的可能。一定要避免細菌，支原體或真菌的污染。
?。?）細胞密度
細胞培養基密度對轉染效率有一定的影響。不同的轉染試劑，要求轉染時的zui適細胞密度各不相同，即使同一種試劑，也會因不同的細胞類型或應用而異。轉染時過高或者過低的細胞密度會導致轉染效率降低，乃至表達水平偏低。因此如果選用新的細胞系或者新的轉染試劑，能夠進行優化實驗并為以后的實驗建立一個穩定方法，包括適當的接種量和培養時間等等。陽離子脂質體具有微量的細胞毒性而往往需要更高的鋪板密度或者更多的懸浮細胞數，有的要求細胞90%匯片；而有些多胺或者非脂質體的配方則要求在40%-80%之間，總之是盡量在細胞zui適的生理狀態下轉染，以求*的轉染效果。
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